Los problemas del Mar Menor han sido provocados por «un exceso de fertilizantes que muchas veces ni incluso el agricultor sabe que está aplicando más del que realmente necesitan». El director general del Agua del Ministerio para la Transición Ecológica, Teodoro Estrela, definió con este argumento la contaminación y los procesos de eutrofización que ha sufrido la laguna salada en las últimas décadas y la necesidad de restaurar los ecosistemas marinos en el marco de la nueva planificación hidrológica para las demarcaciones de cuenca en España.
Junto al Mar Menor, la Albufera de Valencia, las Tablas de Daimiel, el Delta del Ebro o el parque de Doñana son otros espacios naturales donde el Ministerio quiere llevar a cabo una recuperación ambiental los próximos seis años.
