La demolición del muro del Cuartel de Instrucción de Marinería ha generado una agria polémica ciudadana. Numerosos sectores como el Ayuntamiento o los empresarios defienden que estas obras deben ejecutarse debido a que son muy positivas para la ciudad porque facilitan su apertura al mar.

Frente a ellos se encuentra la asociación de defensa del patrimonio Adepa y otros colectivos culturales que defienden que el muro y la antigua farmacia deben mantenerse porque forman parte del conjunto arquitectónico del Arsenal. La decisión final dependerá del juez y de la dirección general de Cultura.